Лекция 8
Э П И Г Е Н Е Т И К А .
Г е н о м н ы й
и м п р и н т и н г .
Три класса исключений из менделевских
закономерностей наследования
Гоносомное
наследование:
• Х
-
сцепленное наследование
• голандрическое
Митохондриальное
наследование
В основе данных отклонений лежат
различия в генетическом вкладе родителей
в генотип потомства
Г Е Н О М Н Ы Й И М П Р И Н Т И Н Г
• Одной из ключевых проблем
современной биологии
является
проблема индивидуального развития
.
• Основной вопрос
этой проблемы:
«Каким образом из одной оплодотворенного
яйца развивается организм,
включающий огромное количество
разнообразных,
узко специализированных клеток?»
В нашем организме
100 триллионов
(10
14
)
клеток.
Которые формируют около
200 разных тканей
Все они имеют
единый геном
- совокупность наследственного материала клетки
В геноме около
3 млрд пар нуклеотидов
30.000 – 40.000 генов
(ранее считалось 100.000),
а
белков в1,5-2 раза больше
? Но почему клетки разных
тканей имеют специфическую
структуру и функции
• В конце XIX в. В.Ру и А.Вейсман предложили гипотезу
наследственно неравного деления: в разные клетки
развивающегося организма попадает разная
генетическая информация.
• Р.Гольдшмидт (1927г) предложил теорию
физиологической генетики: в основе дифференцировки
клеток лежат разные скорости биохимических реакций,
определяемые разными генами.
• Конрад Холл Уоддингтон (C. Waddington): концепция
зародышевого развития на основе изменения экспрессии
генов.
История вопроса
Геном содержит информацию двух видов
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ
информация
-
руководство по
созданию живого
организма
ЭПИГЕНЕТИЧЕСКАЯ
информация
-
как, где и когда должна
быть реализована
генетическая информация
ГЕН
Матричная РНК
Полипептид
Признак
Термин "
эпигенетика
" =
"
эпигенез
" и "
генетика
".
Эпигенетика
– раздел биологии, который изучает
причинно-следственные взаимодействия между
генами и их продуктами, и как они реализуются в
определенные фенотипы.
Термин
"
эпигенетика
"
введен в 1942 г.
эмбриологом Конрадом Холлом Уоддингтоном,
для описания изменений экспрессии генов
в ходе развития
С.
Waddington
(1905-1975)
Термин "
эпигенез
" (от греч. epi – после, сверх, над и genesis –
возникновение, происхождение) был предложен У. Гарвеем
(1651) и означал учение о зародышевом развитии
организмов как процессе, осуществляемом путѐм серии
последовательных новообразований.
В 1990 г. Робин Холлидей дал более конкретное определение
эпигенетики.
«Исследование механизмов временного и
пространственного контроля генной активности в сложных
организмах».
В 1992 г. Брайан Холл определил эпигенетику, как
«сумму
генетических и негенетических факторов, воздействующих на
клетки в целях селективного контроля экспрессии генов,
которые позволяют увеличить фенотипическое разнообразие в
процессе развития»
.
Еще более узкое определение эпигенетики было
предложено в 1996 г. Руссо и соавт.:
«исследование
митотически и/или мейотически наследуемых
изменений в экспрессии генов, которые нельзя
объяснить изменениями в ДНК»
В 2006 году американские учѐные
Эндрю
Файер и Крейг
Мелло
получили
Нобелевскую премию
в области физиологии и медицины
за
«открытие РНК
-
интерференции
-
эффекта гашения активности определѐнных генов»,
опубликованные в 1998 году.
Это были
Первые эпигенетики
Эндрю Файер
Крейг Мелло
Экспрессия генов
— это процесс, в ходе которого
наследственная информация,
заключенная в структуре гена,
реализуется в функциональный
продукт: РНК или белок.
Экспрессия генов может
регулироваться
на всех стадиях
процесса:
• Модификация (ремоделлинг
)
хроматина: гетеро
-
и эухроматин
• Транскрипции
• Посттранскрипционных
процессов
• Трансляции
• Посттрансляционных
процессов
Регуляция может
быть
-
Неспецифическая
-
Специфическая
Регуляторные
регионы могут быть
-
Проксимальными
-
Дистальными
:
энхансеры
,
сайленсоры
,
инсуляторы
Эпигенетическая регуляция
- наследственные и
ненаследственные изменения в экспрессии
конкретного гена без каких-либо соответствующих
структурных изменений в его нуклеотидной
последовательности.
Эпигенетическая наследственная изменчивость играет огромную
роль в
таких фундаментальных общебиологических проблемах, как
индивидуальное развитие организмов,
механизмы экспрессии генов,
возникновение рака
и эволюции.
По
сути
это
означает
модификацию
генной
экспрессии
,
обусловленную
наследственными,
но
потенциально
обратимыми
изменениями
в
структуре
хроматина
и/или
в
результате
метилирования
ДНК
.
Проявление
эпигенетической регуляции
у человека
1. эффекта положения генов
Хромосомные
инверсии
Проявление
эпигенетической регуляции
у человека
2. особенности структурно-
функциональной организации
хроматина определенных
хромосомных локусов
(ремоделлинг хроматина: гетеро-
и эухроматин), влияющих на
экспрессию генов, и РНК-
интерференция
Проявление
эпигенетической регуляции
у человека
3. Инактивация Х-хромосомы
4. Геномный импринтинг
Впервые термин предложил в 1960г. Хелен Кроуз для
описания селективной элиминации отцовских хромосом
у насекомых.
Impint – отпечаток, метка
Геномный импринтинг
- эпигенетический механизм
регуляции экспрессии гомологичных генов в процессе
развития организма в зависимости от родительского
(материнского или отцовского) происхождения гена,
хромосомы или генома.
- совокупность
модификаций, которые по-
разному
«маркируют»
родительские аллели,
представляют собой
Эпигенотип (импринт)
Т.о., в некоторых участках
генома,
подверженных
геномному
импринтингу,
экспрессируется только один
(отцовский или материнский)
аллель,
т.е.
наблюдается
моноаллельная
экспрессия
импринтированных генов, в
отличии
от
обычной
диаллельной экспрессии.
Импринтированные гены (около 100) в диплоидной клетке
млекопитающих обычно экспрессируются только с одного
аллеля (моноаллельная экспрессия генов).
Второй аллель, вследствие наличия на нем некого
«ОТПЕЧАТКА», импринтирован (выключен или подавлен)
и не экспрессируется.
Например, если импринтирован материнский ген, то экспрессируется
отцовский аллель и наоборот.
Такой способ регуляции работы генов
•
свидетельствует о неэквивалентном вкладе родителей в
геном потомков
•
фенотипические
признаки,
контролируемые
импринтированными локусами, могут проявляться не
только в результате мутации генов, но и нарушения
эпигенетической регуляции их экспрессии.
Реализация двойной дозы генов
Моноаллельная экспрессия генов
Геномный импринтинг изменяет дозу генов
(например, контролирующих рост эмбриона, клеточную
пролиферацию и дифференцировку)
Выключение аллелей при моноаллельной экспрессии
происходит на
этапах дифференцировки гамет
В овогенезе
установление
нового
импринта
происходит на
стадии роста
ооцита
I
порядка
В сперматогенезе
срок
установления
мужского
эпигенотипа
окончательно не
установлен.
Вероятно это
происходит на
стадии
сперматоцита
I
порядка до
наступления (или
во время)
профазы
I
мейоза
В основе эпигенетической
«маркировки»
отдельных
участков генома и явлениях
геномного
импринтинга
в
частности лежат специфические
структурно-функциональные
изменения отдельных участков
хромосом,
происходящих
во
время формирования мужских
и женских половых клеток,
которые приводят к стойким
функциональным
различиям
экспрессии гомологичных генов у
потомства.
Мужской
импринт
Женский
импринт
Что обеспечивает
«стирание» отпечатков
родителей
(на уровне премордиальных клеток)
и
установление «новых» отпечатков
(в зрелых половых клетках)
Модели смены эпигенотипа
хромосом в гаметогенезе
1. Переключение эпигенотипа только в той
гомологичной хромосоме, которая
унаследована от родителя
противоположного пола;
2. «стирание» эпигенотипа на обеих
родительских хромосомах с
последующей установкой нового
импринта, соответствующего данному
полу.
Основную роль в этом процессе играют
специфические для особей разного пола
реакции метилирования цитозиновых
оснований
(в CpG-динуклеотидных участках)
ДНК
(в С
5
позиции, симметрично в
двух цепочках)
,
которое устанавливается в ходе
гаметогенеза и выключает транскрипцию
генов.
Метилирование
ДНК
Изучение геномного импринтинга у млекопитающих
началось в начале 80-х годов ХХв.
после опытов на мышах, проведенных
Дж.МакГратом, Д.Солтером и М.Сурани.
Изучение геномного импринтинга
Развитие нового организма начинается с
оплодотворения яйцеклетки сперматозоидом.
Биологическое значение которого восстановление
диплоидного набора хромосом (2n)
За счет слияния «мужского» и «женского»
пронуклеусов
Мужской и женский пронуклеусы
считаются генетически
эквивалентными
,
НО
исследования
показали, что между этими
пронуклеусами
имеются
функциональные различия
.
Эксперименты на мышах позволили создать и
проследить развитие зародышей с двумя
гомологичными хромосомными наборами от
одного родителя.
Эпибласт
-
зародышевые
листки
-
внезародышевые
оболочки
:
амнион,
аллантоис
Гипобласт
-
образование
желточного
мешка.
Бластоциста
Образование хориона
Эксперемент
по трансплантации
(пересадке)
пронуклеусов на мышах
Андрогенетические зиготы -
нормальное развитие зародышевых
мембран и плаценты, практически нет
развития эмбриональных структур.
Гиногенетические зиготы -
нормальное развитие
эмбриональных структур и плохое -
зародышевых мембран и плаценты.
Это проявление
Импринтинга целого генома
Эпигенетическая патология у человека (1)
Пузырный занос
Исход андрогенетической
зиготы
Тератома
Исход гиногенетической
зиготы
Триплоидия
Андроид
Гиноид
Тератома
(эмбриональная опухоль)
- хорошо развит эмбрион
(все
три эмбриональных слоя)
и
отсутствие плацентарной
ткани
Причина: два набора
материнских хромосом.
Маленькая (4 сантиметра) киста
яичника
Тератома
(чудовище+опухоль)
– это
опухоль содержащая ткань или
орган организма.
В тератоме могут присутствовать:
волосы, мышечная ткань, костная
ткань, зубы, глаза, конечности и пр.
Истинный пузырный занос
– хорошо развиваются
плацентарные структуры
(из-за
бурного разрастания трофобласта)
,
нет эмбриональных структур
Причина: два набора
отцовских хромосом
Оплодотворение яйцеклетки,
лишенной материнских хромосом
двумя сперматозоидами
Выявляется в сроки 11
-
25 нед беременности,
Первым клиническим признаком является несоответствие
размеров матки сроку беременности: матка больше срока
беременности.
Макроскопически визуализируются отечные хориальные
ворсинки, пузырьки.
норма
Гиноид
Причина: 2n - мать + n - отец
Проявление:
• недоразвитая плацента,
•
клеточная масса,
• эмбрион и плод не
развивается.
Триплоидия
Андроид
Причина: 2n - отец + n - мать
Проявление:
• большая кистозная плацента,
• у плода:
большая голова,
маленькое веретенообразное
тело,
синдактилия,
отставание в росте и
развитии.
Если плод рождается,
то, как правило,
есть мозаицизм.
Триплоидия
69,XXX
69,XXY
69,XYY
летальна
Механизмы формирования триплоидии
диспермное оплодотворение 50
-65%
слияние диплоидной и гаплоидной гамет 20
-35%
эндорепликация одного из родительских геномов в
диплоидной зиготе
Новорожденные с кариотипами
69,XXX (верхний ряд) и 69,XXY (нижний ряд)
Источник: Schinzel A. Catalogue of unbalanced chromosome aberrations in man: Second revised and
expanded edition. – Walter de Gruyter: Berlin – New York. 2001. – 966 p.
• небольшой вес
• широкий задний
родничок с
недоразвитыми
затылочными и
теменными
костями черепа
• расщелина неба
• синдактилия 3 и 4
пальцев рук
• пороки сердца
Основные
клинические
проявления
триплоидии
Тетраплоидия
92,XXXX
92,XXYY
92,XYYY
летальна
Механизмы формирования тетраплоидии
• нарушение цитокинеза при дроблении бластомеров
• слияние двух диплоидных гамет
• оплодотворения яйцеклетки тремя гаплоидными
сперматозоидами
Чистый вариант тетраплоидии
у пациента в возрасте 26 месяцев
Источник:
Guc-Scekic M., Milasin J., Stevanovic M., et al. Tetraploidy in a 26-month-old girl (cytogenetic and molecular
studies) // Clin. Genet. 2002. V. 61. P. 62-65.
• внутриутробная
задержка развития
• гипотония
• лицевые
аномалии
(выступающий
лоб,
микрофтальмия,
низко посаженные
уши, расщелина
неба)
• пороки сердца
• нарушения
психомоторного
развития
Основные
клинические
проявления
тетраплоидии
Организменный (хромосмный) уровень импринтинга:
однородительская диссомия (ОРД)
Однородительская дисомия - наследование обеих копий целой
хромосомы или ее части от одного родителя (при отсутствии
соответствующего
генетического
материала
от
другого
родителя).
Это
качественный
,
а не количественный хромосомный
дисбаланс
Изодисомия
Коррекция
моносомии до дисомии,
при не расхождение хроматид
во II мейотическом делении
Приводит к гомозиготизации
Гетеродисомия
Коррекция
трисомии до дисомии,
происходящая из-за
не расхождение хромосом
в I мейотическом делении.
Эпигенетическая патология у человека (2)
Схематическое
изображение
нерасхождения одной
пары хромосом в 1-м
мейотическом делении.
А
Б
В результате слияния
аномальной гаметы с
нормальной гаметой
образуются зиготы с
• трисомией
(1)
• или моносомией
(2) по
данной хромосоме.
А –
мейотические
деления
I
и
II;
Б –
зиготы 1 и 2.
(Н.П. Бочков и др., 1984
Однородительская дисомия
Разные хромосомы вносят различный вклад в
нормальное развитие плода.
Дисомии по 1,3,4,8,9,10,13,15,16,18 и 19 не вызывали
отклонений от нормального развития мышиных
эмбрионов,
а по 2,6,7,11,17 сопровождались отклонениями от
нормального развития и гибелью плода
Болезни импринтинга
- это заболевания в основе которых лежит нарушение
функции импринтированных участков генома
• Феномены импринтинга отдельных генов и хромосом лучше
изучены на мышах.
• Но известна гомология по 700 локусам между хромосомами
человека и мышей.
• Импринтированные гены и их транскрипты обнаружены
на многих хромосомах человека –
1, 5, 6, 7, 11, 13,
15
, 19, 20 и
Х.
Эпигенетическая патология у человека (3)
Известно уже более 30 таких болезни
Синдром
Ангельмана
(Энжельмена )
15q11-q13
Патология
материнской
хромосомы
Синдром
Прадера -
Вилли
Патология
отцовской
хромосомы
15q11-q13
Ген
СПВ
Ген
СА
Активный ген СА
Активный ген СПВ
Неактивный ген СПВ
НеаАктивный ген СА
В норме у здорового человека
наблюдается моноаллельная
экспрессия генов СА и CПВ в
следствие наследуемого геномного
импринтинга (эпигенетическая
наследственность).
Ген СА – активен и экспрессируется
на материнской хромосоме
Ген CПВ – активен и
экспрессируется на отцовской
хромосоме
Причины, приводящие к СПВ и СА.
П М М М П М П(М) М П П М
СПВ
70% 25% 0 <5% 0.1%
П М П П П М П М(П) М М П
СА
70% 2% 20% <5% <0.1%
Делеции
ОРД
Мутации
в генах
-
кандидатах
Мутации
центра
импринтинга
Сбалансированные
транслокации
Ген
СПВ
Ген
СА
Если регион
CПВ отсутствует
на отцовской
хромосоме
или имеет место
материнская ОРД
→ экспрессии гена не
происходит
→ формируется
функциональная
нуллисомия
→ развивается фенотип
Синдрома Прадера-Вилли
Ген
СПВ
Ген
СА
Если регион
CА отсутствует на
материнской
хромосоме
или имеет место отцовская
ОРД
→ экспрессии гена не
происходит
→ формируется
функциональная
нуллисомия
→ развивается фенотип
Синдрома Ангельмана
Мутации в генах
-
кандидатах
Делеций и ОРД не обнаружено, но имеются фенотипические
эффекты данных заболеваний
?
?
В таких семьях встречаются повторные случаи таких больных
В ходе исследований
в хромосоме 15 были обнаружены
(близко расположенные)
противоположно импринтированные гены.
Такие гены были названы гены-кандидаты
Ген-кандидат CПВ
- SNRPN
Ген-кандидат CА
– UBE3A
Мутации центра импринтинга
Мутация «центра импринтинга» приводит к ошибкам
импринтинга – не происходит «стирание» отпечатков
предшествующих поколений
Область 15ой хромосомы
с расположенными в ней генами
CПВ и его геном-кандидатом, а также
геном СА и его геном-кандидатом, имеет
ЧРЕЗВЫЧРЙНО ВАЖНОЕ значение
для геномного импринтинга.
Она названа
ЦЕНТРОМ ИМПРИНТИНГА (IC)
Он обеспечивает
«стирание» отпечатков
родителей
Мужской
импринт
Женский
импринт
Поэтому если в сперматогенезе отца не происходит смена
«женского» импринта на «мужской» на его материнской
хромосоме,
то в следующем
поколении
возникает
состояние
аналогичное
ОРД,
которое
будет
давать
фенотип
болезни
импринтинга
(СА или СПВ)
Синдром Прадера
-
Вилли
Портрет
Евгении
Мартинес
Валеджо.
Девочке 6 лет,
вес 54 кг.
1680г
Музей Прадо,
Мадрид
• долихоцефалия,
• гипертелоризм,
• эпикант,
• микрогнатия,
• высокое небо,
• Ожирение,
• мышечная
гипотония,
• низкий рост,
• гипогонадизм
• умственная
отсталость
различной
степени
выраженности
Частота синдрома в
популяции 1:10
-
20 тыс.
• миндалевидный разрез глазных
щелей,
• диспластичные ушные раковины,
• аномалии дерматоглифики
Признаки дизэмбриогенеза
:
Синдром Прадера
-
Вилли
до рождения:
• низкая подвижность плода;
• часто — неправильное положение
плода;
• дисплазия тазобедренных суставов;
• ожирение;
• склонность к перееданию (чаще
проявляется к 2-м годам);
• пониженный мышечный тонус
(гипотонус);
• пониженная координация
движений;
• маленькие кисти и стопы, низкий
рост;
• повышенная сонливость;
• Стробизм (косоглазие);
• сколиоз (искривление
позвоночника);
Синдром Прадера —
Вилли
пониженная плотность костей;
густая слюна; плохие зубы;
сниженная функция половых желёз
(гипогонадизм);
как правило, бесплодие;
речевая задержка,
задержка психического развития;
отставание в освоении навыков
общей и мелкой моторики.
более позднее половое созревание.
Внешние признаки: у взрослых
выражена переносица; лоб высокий
и узкий; глаза, как правило,
миндалевидные; губы узкие.
Но все это нельзя найти в одном
ребенке, чаще встречается не более
пяти вышеуказанных признаков.
Синдром Ангельмана
(15q11-q13)
Частота синдрома
в популяции
составляет 1:20000
Синдром Ангельмана
Неврологические проявления
:
• тяжелая задержка умственного и
моторного развития,
• Атаксия
(беспорядочное движение; нарушение
согласованности движений различных мышц при условии отсутствия
мышечной слабости),
• гипотония,
• судорожная готовность,
• гиперрефлексия
и гиперкинезия
,
• приступы неконтролируемого смеха,
• хлопанье в ладоши.
Синдром
Ангельмана
Признаки
дизэмбриогенеза
:
• микробрахицефал
ия с уплощенным
затылком,
• большая нижняя
челюсть,
• приоткрытый рот с
выступающим
языком,
• макростомия,
• редко растущие
зубы,
• гипопигментация
ОПРЕДЕЛЕНИЕ МИКРОДЕЛЕЦИЙ ХРОМОСОМЫ 15q11.2 ПРИ
СИНДРОМАХ ПРАДЕРА-ВИЛЛИ И АНГЕЛЬМАНА МЕТОДОМ FISH
(ДНК-зонд SNRPN).
Связь геномного импринтинга с другими
наследственными заболеваниями
При хорее Гентингтона и спино-мозжечковой атаксии I типа
заболевание возникает раньше и протекает тяжелее, если
унаследованные гены имеют отцовское происхождение
При нейрофиброматозе I и II типов миотонической дистрофии
заболевание имеет более раннее начало и тяжелое тячение
при унаследовании мутантных генов от матери
Значение геномного импринтинга выявлено и для этиологии
опухолевого роста. Т.к. нарушается экспрессия генов.
Например,
• четко
выраженный
отцовский
импринт
обнаружен
при
атопическом
дерматите,
• а
материнский
–
при
бронхиальной
астме
и
атопии
у
детей
.
Феномен геномного импринтиннга
и мультифакториальные болезни
• При инсулинзависимом
сахарном диабете –
более
высокая вероятность отцовского импринта
.
• У детей с неонатальным сахарным диабетом
обнаружена ОРД отцовского происхождения (11р15)
Синдром
Мартина-Белл
синдром ломкой
X-
хромосомы,
fragile X mental retardation syndrome,
FraX (
от англ.
fragile
—
хрупкий, ломкий)
Развитие
синдрома
связано
с
экспансией
единичных
тринуклеотидов
(
ЦГГ
)
в
Х
хромосоме
и
приводит
к
недостаточной
экспрессии
белка
FMR1,
который
необходим
для
нормального
развития
нервной
системы
.
ЭКСПАНСИЯ ТРИНУКЛЕОТИДНЫХ ФРАГМЕНТОВ - патологическое состояние: вариант
генетической мутации, характеризующийся появлением в ДНК "бессмысленных"
повторов
тринуклеотидов,
которые
могут
приводить
к
дезорганизации
функционирования ДНК или синтезу патологического белка, накапливающегося в
клетках, что приводит к гибели клетки.
Лежит в основе ряда заболеваний (синдрома Мартина-Белла, болезни Гентингтона,
болезни Кеннеди, спиноцеребеллярных дегенерации и т.д.),
тяжесть которых зависит
от числа повторов тринуклеотидов
.
Общая особенность этой группы заболеваний - более раннее начало и нарастание
тяжести их клинических проявлений из поколения в поколение, что обычно отражает
увеличение числа тринуклеотидных повторов (феномен антиципации).
Схема расположения фолатчувствительных
ломких сайтов на Х-хромосоме
Число
триплетов
CGG
Метилирование
промотора гена
FMR1
Фенотип
СМБ
норма
2-54
-
-
премутация
55-230
-
-
полная
мутация
230
+
+
Достарыңызбен бөлісу: |