Ролью изучения почвенной ДНК в понимании структуры сообществ микроорганизмов в почве



Дата08.07.2017
өлшемі445 b.



Ролью изучения почвенной ДНК в понимании структуры сообществ микроорганизмов в почве

  • Ролью изучения почвенной ДНК в понимании структуры сообществ микроорганизмов в почве

  • Спецификой выделения ДНК из почвы (высокое содержание гуминовых кислот)

  • Сравнительно небольшим количеством эффективных методик выделения



Разработать методику использования лаурилсаркозината натрия и SDS для выделения почвенной ДНК

  • Разработать методику использования лаурилсаркозината натрия и SDS для выделения почвенной ДНК

  • Провести извлечение ДНК из почвенных образцов, согласно разработанной процедуре

  • Осуществить качественный анализ ДНК, выделенной в ходе исследования

  • Сравнить эффективность лаурилсаркозината натрия и SDS как основных детергентов для извлечения почвенной ДНК; оценить влияние применения растворов гуанидин хлорида и СТАВ на ход выделения





«+»

  • «+»



Физическое воздействие (замораживание-оттаивание образца, гомогенизация с бусинами, дробление частиц почвы ультразвуком и т.п.)

  • Физическое воздействие (замораживание-оттаивание образца, гомогенизация с бусинами, дробление частиц почвы ультразвуком и т.п.)

  • Химический лизис (обработка детергентами или хаотропными агентами)

  • Ферментативный лизис (применение лизоцима, протеиназы К)

  • Очистка полученного препарата ДНК



Определение оптимальной концентрации лаурилсаркозината натрия

  • Определение оптимальной концентрации лаурилсаркозината натрия











Выделение ДНК в случае использования лаурилсаркозината натрия возможно без применения раствора гуанидин хлорида

  • Выделение ДНК в случае использования лаурилсаркозината натрия возможно без применения раствора гуанидин хлорида

  • При использовании в качестве детергента SDS лучше использовать его совместно с раствором гуанидин хлорида

  • Оптимальными концентрациями являются для SDS – 2%, для лаурилсаркозината – 4%

  • Добавление 1 % СТАВ к растворам лаурилсаркозината натрия и SDS и 0,5 % СТАВ к раствору SDS вызвало уменьшение количества выделенной ДНК



Российская академия сельскохозяйственных наук. Всероссийский научно исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии. Выделение ДНК из образцов почвы: методические указания. – СПб.: 2011. – 24 с.

  • Российская академия сельскохозяйственных наук. Всероссийский научно исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии. Выделение ДНК из образцов почвы: методические указания. – СПб.: 2011. – 24 с.

  • Кулмамабетова Г. Современные проблемы биологии, ЕНУ, Астана. – 2012.

  • Селиверстова Е.Ю., Сазыкин И.С., Сазыкина М.А., Хмелевцова Л.Е., Рынза И.С. Использование различных концентраций лаурилсаркозината натрия и SDS для выделения ДНК из почвы // Валеология. – 2015. - № 3. – С.42-46

  • Манучарова Н.А. Молекулярно-биологические аспекты исследований в экологии и микробиологии: Учебное пособие. – М. Издательство МГУ, 2010. – С. 47

  • Rajendhran J., Gunasekaran P. Strategies for accessing soil metagenome for desired applications // Biotechnology Advances. – 2008 – V.26 – P. 576–590

  • Zhou, J. et all // Appl Environ Microbiol. – 1996. – Vol. 62 (2). – P. 316–322.





Лаурилсаркозинат натрия и SDS могут использоваться в качестве основных детергентов при извлечении ДНК из почвы

  • Лаурилсаркозинат натрия и SDS могут использоваться в качестве основных детергентов при извлечении ДНК из почвы





Достарыңызбен бөлісу:


©stom.tilimen.org 2019
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет