Прокариоты



Дата18.03.2018
өлшемі445 b.





Прокариоты

  • Прокариоты

  • N-формил-метионил-тРНК-f (F-Met-tRNAf) (аминогруппа блокируется – тРНК не может участвовать в элонгации)











IRES – internal ribosomal entry sites

  • IRES – internal ribosomal entry sites

  • Обеспечивают внутреннюю инициацию на некоторых мРНК эукариот (в основном используются вирусами)

  • Относительно большие и сложные структуры (в отличие от SD-последовательностей прокариот)

  • Механизм действия: связывание компонентов транскрипционного аппарата

  • Примеры:

  • Пикорнавирусы (полиовирус, вирусы гепатита А, простого насморка, ящура)

  • Связывают 4G, не требует 4E

  • HCV (вирус гепатита C)

  • Связывает 40S, не требует 4F

  • CrPV (вирус паралича сверчка)

  • Связывает 80S, не требует никаких факторов



Что влияет на эффективность:

  • Что влияет на эффективность:

  • Степень комплементарности и длина последовательности SD

  • Вовлечение инициаторной последовательности во вторичные и третичные структуры

  • Регуляция:

  • Репрессия за счет белков, связывающихся с инициаторными районами

  • Вторичная структура может усиливаться связыванием с белками или низкомолекулярными лигандами

  • Riboswitches – связывают низкомолекулярные лиганды (витамины, нуклеотиды и т.п.), производящие «переключение» между различными вторичными структурами



Фосфорилирование eIF2

  • Фосфорилирование eIF2

  • Связывание eIF4E белком 4E-BP



В ответ на различные условия стресса одна из 4 киназ фосфорилирует альфа-субъединицу фактора eIF2 по Ser51

  • В ответ на различные условия стресса одна из 4 киназ фосфорилирует альфа-субъединицу фактора eIF2 по Ser51

  • Фосфорилированный eIF2 – ингибитор для eIF2B (за счет слишком плотного связывания)

  • Не происходит реактивации комплекса



GCN4 мРНК в дрожжах

  • GCN4 мРНК в дрожжах

  • Кодируемый белок является транскрипционным активатором генов, регулирующих биосинтез аминокислот

  • Имеет 4 короткие ORF ближе к 5’-концу от инициаторного кодона GCN4

  • Трансляции GCN4 начинается благодаря реинициации



eIF4E в составе eIF4F связывается с кэпом, в результате чего комплекс связывается с мРНК

  • eIF4E в составе eIF4F связывается с кэпом, в результате чего комплекс связывается с мРНК

  • eIF4E-binding proteins (4E-BPs) в дефосфорилированной форме конкурируют с eIF4G за связывание с eIF4E ->

  • 4E-BPs ингибируют кэп-зависимую трансляцию





Наиболее изученный механизм

  • Наиболее изученный механизм

  • мРНК кодирует белок ферритин, отвечающий за связывание излишков железа в клетке. При малом количестве железа вреден.

  • IRE – iron-responsing elements – области мРНК, участвующие в регуляции

  • IRP - IRE regulatory proteins – регуляторные белки (IRE-BP)

  • При недостатке железа IRP связываются со шпилькой IRE в 5’ UTR

  • Блокирует сканирование 5’UTR





Механизм до конца не выяснен

  • Механизм до конца не выяснен

  • Небольшие молекулы ~22 нуклеотида

  • Действуют в комплексе с белками (miRNP или RISC – RNA-induced silencing complex)

  • Комплементарно связывается с 3’UTR



Каталог: FBB -> year 07 -> term4 -> MolBiol -> ppt
FBB -> Какие программы использовались
ppt -> Созревание мрнк кэпирование: мярнп
ppt -> Ef-tu*gdp комплекс ef-tu*aa-trna*gtp связан с рибосомой
ppt -> Днк в ядре клеток человека~1 м Cредний d ядра ~10 мкм
ppt -> Отрицательная сверхспирализация
ppt -> У эукариот есть три различные рнк полимеразы I, II и III, ответственные за транскрипцию с соответствующих промоторов
ppt -> Прокариоты: инициация и регуляция транскрипции рнк-полимераза
year 07 -> Что такое биоинформатика?


Достарыңызбен бөлісу:


©stom.tilimen.org 2019
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет