Прокариоты: инициация и регуляция транскрипции рнк-полимераза



Дата18.03.2018
өлшемі445 b.


Прокариоты: инициация и регуляция транскрипции


РНК-полимераза





Субъединицы β и β’

  • формируют активный центр фермента

  • Связываются:

    • с матричной цепью ДНК
    • с новосинтезированной РНК


Субъединицы α

  • 2 домена и линкерная область (ок. 20 ак)



σ-фактор

  • распознавание промоторной последовательности

  • привлечение на промотор главного элемента РНК-полимеразы

  • расплетание дуплекса ДНК в области старта транскрипции.



Альтернативные σ-факторы

  • Гены ответа на тепловой шок

  • Гены ассимиляции азота

  • Имеют собственные последовательности промоторов, отличающиеся от промоторов основного σ-фактора



Последовательность промотора



Этапы транскрипции

  • ДНК (2ая спираль) + σ-фактор + главный компонент РНК-полимеразы = закрытый промоторный комплекс

  • Расплетание ДНК – открытый промоторный комплекс

  • Инициация транскрипции – образование первых звеньев цепи РНК

  • От РНК-полимеразы отделяется σ-фактор

  • Элонгация



Факторы транскрипции

  • Белки, связывающиеся с промотором и регулирующие транскрипцию

  • Большинство высокоспецифичны

  • Большинство контролируют экспрессию нескольких генов

  • 3 механизма воздействия «стимул -> фактор»:

      • взаимодействие фактора с лигандом
      • ковалентная модификация регуляторного белка
      • регуляция гена фактора транскрипции


Взаимодействие фактора транскрипции с лигандом

  • PurR – регулятор биосинтеза пуриновых нуклеотидов

  • Репрессор

  • Связывание с сайтами в присутствии лигандов

  • имеет ДНК-связывающий N-концевой домен и лиганд-связывающий C-концевой домен



Факторы транскрипции



Механизмы активации

  • Активаторы класса I

  • связываются с последовательностью перед UP-элементом

  • взаимодействуют с С-концевым доменом a-субъединицы РНК-полимеразы

  • Активаторы класса II

  • связываются с последовательностью перед сайтом –35

  • взаимодействуют с доменом σ -субъединицы

  • Активаторы, изменяющие конформацию промотора

  • связываются с последовательностью между –35 и –10 элементами промотора

  • взаимодействуют с доменом σ -субъединицы



Механизмы репрессии

  • Стерическая помеха

  • Сворачивание ДНК

  • Репрессия активатора



Обратная связь: положительная

  • Пример: транскрипционный регулятор EutR, контролирующий расщепление этаноламина

  • Его ген находится внутри регулируемого оперона eut (утилизация этаноламина)



Обратная связь: отрицательная

  • На примере фактора транскрипции RbsR

  • Рибоза – эффектор

  • Гены кодируют высоко-специфичную систему транспорта рибозы





Достарыңызбен бөлісу:


©stom.tilimen.org 2019
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет