70
Наука та інновації. 2009. Т. 5. № 6. С. 70—74.
© К.В. ДМИТРУК, В.Ю. ЯЦИШИН,
А.Я. ВОРОНОВСЬКИЙ, Д.В. ФЕДОРОВИЧ,
А.А. СИБІРНИЙ, 2009
К.В. Дмитрук, В.Ю. Яцишин,
А.Я. Вороновський, Д.В. Федорович, А.А. Сибірний
Інститут біології клітини НАН України, Львів
КОНСТРУЮВАННЯ НАДПРОДУЦЕНТІВ РИБОФЛАВІНУ
(ВІТАМІНУ В
2
) ДРІЖДЖІВ CANDIDA FAMATA
Шляхом введення додаткових копій гена позитивного регулятора біосинтезу рибофлавіну (РФ) у геном раніше
селекціонованих штамів дріжджів Candida famata, здатних до надсинтезу РФ, отримано стабільні дріжджові штами-
надпродуценти вітаміну В
2
. Підібрано оптимальні середовища та умови культивування для максимального виходу
цільового продукту — РФ.
К л ю ч о в і с л о в а: рибофлавін (вітамін В
2
), дріжджі, Candida famata, надсинтез, штами-продуценти.
Рибофлавін (РФ) є одним із найважливі-
ших ростових факторів людини і тварин. До-
бова потреба людини у вітаміні В
2
складає
приблизно 2 мг. Дефіцит вітаміну В
2
виникає
при інтенсивному рості організму, при вагіт-
ності, після тривалого лікування антибіотика-
ми.
РФ успішно застосовується при лікуванні
мігрені та малярії [1].
Надзвичайно важливою
передумовою росту тварин та птахів є достат-
ня забезпеченість кормів вітаміном В
2
. Дефі-
цит РФ у кормових раціонах веде до порушен-
ня обміну речовин, затримки росту, погіршен-
ня засвоєння амінокислот і жирів, послаблен-
ня зору, дерматозів, зниження продуктивності
і використання поживних речовин у кормах та
їжі. Введення РФ у склад преміксів, комбікор-
мів і кормосумішей для тварин і птиці підви-
щує їх приріст, покращує виживання молод-
няка, збільшує продуктивність, знижує затра-
ти кормів на одиницю продукції.
В Україні виробництво препаратів РФ від-
сутнє. У світі виробляється близько 6,5 тис.
тон РФ. Приблизно 60 % загального виробни-
цтва РФ використовується в сільсь ко му гос-
подарстві як додаток до кормів, решта 40 % —
в медицині як компонент полівітамінних сумі-
шей та лікарських препаратів
[
2, 3
]
. РФ про-
тягом десятків років синтезують хімічним спо-
собом. Проте в останні роки спостерігається
заміщення хімічного синтезу РФ біотехноло-
гічним із застосуванням аскоміцет ного гри ба
Ashbya gossypii, генно-інженерних шта мів бак-
терії Bacillus subtilis та дріжджів Candida famata
[
4, 5, 6, 7
]
. Мікробний синтез дозволяє заоща-
дити майже половину коштів, зменшити енер-
гетичні затрати та уникнути забруднення на-
вколишнього середовища
[8]
.
Позитивним у виробництві РФ з викорис-
танням дріжджів є здатність цих мікроорганіз-
мів рости на простих живильних середовищах,
напівпродуктах та відходах харчової промис-
ловості. Крім того, дріжджова біомаса є цін-
ним джерелом збалансованого за амінокис-
лотним складом кормового білка. Серйозним
недоліком промислового штаму C. famata, який
використовувався американською біотехноло-
гічною фірмою Archer Daniels Midland, є його
71
Наука та інновації. № 6, 2009
Науково-технічні інноваційні проекти Національної академії наук України
генетична нестабільність і реверсія до штамів,
які втрачають здатність до надсинтезу вітамі-
ну В
2
. Створення стабільних дріжджових про-
дуцентів із підвищеною ефективністю синтезу
РФ дасть можливість налагодити прибуткове
виробництво препаратів цього вітаміну.
У наших попередніх дослідженнях
[9]
було
ідентифіковано та клоновано ген SEF1, що ко-
дує позитивний регулятор біосинтезу РФ
дріжджів C. famata. З’ясовано, що цей меха-
нізм регуляції біосинтезу РФ є універсальним
для інших видів дріжджів, здатних до надсин-
тезу вітаміну В
2
. У даній роботі представлено
конструювання високопродуктивного стабіль-
ного дріжджового штаму — продуцента РФ —
шляхом введення додаткових копій гена SEF1
та підбір умов для ефективної продукції віта-
міну В
2
.
МАТЕРІАЛИ І МЕТОДИ
Дріжджі вирощували у колбах та пробірках
у багатому середовищі YPD (глюкоза — 20 г/л;
пептон — 10 г/л; дріжджовий екстракт — 5 г/л),
мінімальному середовищі Беркгольдера (саха-
роза — 20 г/л; (NH
4
)
2
SO
4
— 3 г/л або сечовина —
1 г/л; KH
2
PO
4
— 0,5 г/л; MgSO
4
·7H
2
O — 0,2 г/л;
CaCl
2
·6H
2
O — 0,2 г/л; біотин — 1 мкг/л; мікро-
елементи (0,5 мл/л): B
3+
— 0,01 мг/л, Cu
2+
—
0,01 мг/л, Mn
2+
— 0,01 мг/л, Mo
4+
— 0,01 мг/л,
Zn
2+
— 0,07 мг/л) та в промислових середови-
щах різного складу на качалці (200 об./хв.) при
28 °С протягом 2—6 діб. Для засіву викорис-
товували 1—2-добову культуру дріжджів, ви-
рощену на агаризованому YPD.
Біомасу дріжджів визначали турбідиметрич-
ним методом на концентраційному фотоелек-
тричному колориметрі КФК-2МП (λ = 540 нм,
кювета — 3 мм), розраховуючи суху вагу за ка-
лібрувальною кривою. Вміст флавінів у куль-
туральній рідині визначали флуорометрично
на флуорометрі Turner Quantech Digital Fiiter
Flu o rometere FM109510-33, використовуючи
як стандарт синтетичний РФ.
Електротрансформацію дріжджів С. famata
проводили, як описано раніше
[10]
. Виділення
сумарної ДНК із клітин С. famata здійснюва-
ли за допомогою комерційного набору DNea-
sy® Tissue Kit (Qiagen, Німеччина). Виділен-
ня та очистку плазмідної ДНК, підготовку та
трансформацію компетентних клітин E. coli,
елек трофорез ДНК в агарозному гелі, елюцію
фрагментів ДНК з агарозного гелю, розщеп-
лен ня ДНК рестриктазами, дефосфорилюван-
ня “липких” кінців ДНК, ліґування лінеаризо-
ваних фрагментів ДНК, ампліфікацію фрагмен-
тів ДНК за допомогою полімеразної ланцюго-
вої реакції (ПЛР) здійснювали згідно з
[11]
.
При ампліфікації фрагментів ДНК за допомо-
гою ПЛР використовували синтетичні оліго-
нуклеотидні праймери фірми “IDT Tech no lo-
gies” (США).
РЕЗУЛЬТАТИ ТА ОБГОВОРЕННЯ
Конструювання стабільного надсинтетика
РФ полягало у введенні додаткової копії гена
SEF1 Debaryomyces hansenii у геном штаму AF4
C. famata, селекціонованого в нашій лаборато-
рії за допомогою класичного мутагенезу ко-
лекційного штаму C. famata ВКМ Y-9, та ви-
користанні селективних середовищ
[12]
.
Від-
бір флавіногенного штаму методами класичної
селекції включав 6 етапів. Як мутаген вико-
ристовували ультрафіолет, нітрозогуанідин та
етилметансульфонат.
Протягом кожного ета-
пу селекції перевіряли здатність відібраних
флавіногенних мутантів до росту в середови-
щі з етанолом як єдиним джерелом вуглецю
та енергії і відбирали для подальшого покра-
щення лише ті штами, які здатні утилізувати
етанол. Це давало можливість уникнути не без -
пеки реверсії флавіногенних штамів за оз на кою
здатності рости на етанолі, що корелює у про-
мислового продуцента РФ, штаму ATCC 20849,
із втратою здатності до надсинтезу
вітаміну В
2
.
Найбільш флавіногенним се
ред перевірених
виявився штам AF4, що наг ро маджував до 688
мг РФ/л за 4 доби ку ль тивування в колбах на
круговій качалці при 200 об./хв.
Для ведення в геном мутанта AF4 додатко-
вої копії гена SEF1 D. hansenii його трансфор-
72
Наука та інновації. № 6, 2009
Науково-технічні інноваційні проекти Національної академії наук України
мували плазмідою
pTDhSEF
1
[9]
,
що містила,
окрім
гена
SEF1, ген ble Staphylococcus aureus,
котрий забезпечує резистентність до флеомі-
цину
.
Відбирали штами, здатні до росту на се-
лективному середовищі, і за допомогою ПЛР
підтверджували наявність у них плазміди.
Нами було відібрано штам AF4/SEF1
,
який
нагромаджує при вирощуванні в колбах у цук-
рово-мінеральному середовищі більше 1 г РФ/л
(див. рисунок). Цей штам отримав назву Can-
di da famata IMB Y-5034
[12]
. Продуктивність
фла віногенезу (кількість утвореного РФ в пе-
рерахунку на одиницю біомаси) сконструйова-
ного штаму C. famata IMB Y-5034 на 3-ю добу
культивування у 3 рази вища, ніж у вихідного
штаму C. famata AF4. Продуктивність біосин-
тезу РФ у промислового штаму C. famata АТСС
20849 при вирощуванні у такому ж середовищі
не перевищує 30 мг РФ/г біомаси.
Проведено аналіз стабільності за ознакою
«надсинтез РФ» у отриманого штаму. Як конт-
ро льні були використані штами C. famata IMB
Y-5033 та AF4. Частота реверсії для раніше
отриманого штаму — надсинтетика РФ C. fa-
ma ta IMB Y-5033 становить 13,8 × 10
–6
, а шта-
му AF4 — 0,4 × 10
–6
. Сконструйований штам C.
famata IMB Y-5034 характеризується високою
стабільністю: після 14 днів культивування він
не утворює
нефлавіногенних клонів, здатних
до утворення білих, великих за розміром, ко-
лоній при рості на середовищі з етанолом.
З метою підвищення флавіногенної актив-
ності отриманого рекомбінантного штаму в
його геном було введено другу додаткову ко-
пію гена SEF1 дріжджів D. hansenii. Введення
генетичної інформації у геном реципієнта ви-
магає селективного маркера, завдяки якому
можна відібрати відповідні рекомбінантні шта-
ми. Для цього було сконструйовано плазміду,
яка містить новий домінантний селекційний
маркер для C. famata — ген IMH3 D. hansenii, що
кодує інозинмонофосфат дегідрогеназу і визна-
чає стійкість до мікофенолової кислоти
[13].
Сконструйованою плазмідою трансформува-
ли кращий наявний штам — продуцент РФ C. fa-
mata IMB Y-5034 (AF4/SEF1). З окремих ко-
лоній отриманих трансформантів виділяли
сумарну ДНК та аналізували її за допомогою
ПЛР-аналізу на наявність селективного марке-
ра — гена IMH3. В результаті було відібрано
штам AF4/2хSEF1, в геномі якого міститься
щонайменше дві копії гена SEF1 D. hansenii. У
штаму AF4/2хSEF1 визначали рівень синтезу
РФ та вираховували продуктивність флавіно-
генезу. Виявлено, що за продуктивністю синте-
зу РФ сконструйований штам перевищує ви-
хідний штам AF4/SEF1 на 25% (див. рисунок).
Було досліджено флавіногенну активність
низки рекомбінантних штамів, похідних AF4,
які містили додаткову копію гена SEF1, при
вирощуванні у середовищах різного складу
(табл. 1). Найкращий ріст та нагромадження
РФ дослідженими рекомбінантними штамами —
похідними AF4, які містили додаткову копію
гена SEF1, — забезпечувало середовище, що
містило 0,5 % дріжджового екстракту. Макси-
мальний вихід РФ (більше 1 г/л) спостерігав-
ся на 5-у добу вирощування. При цьому про-
дуктивність флавіногенезу штамів, що місти-
ли додаткову копію гена SEF1, була в 2,5 рази
вищою, ніж у штаму-реципієнта AF4.
Продуктивність флавіногенезу штамів AF4, AF4/SEF1,
AF4/2xSEF1
73
Наука та інновації. № 6, 2009
Науково-технічні інноваційні проекти Національної академії наук України
Нагромадження РФ в культурі залежало від
джерела азоту. Максимальний вихід РФ для
штаму № 12 (AF4/SEF1) отримано при виро-
щуванні в середовищі, що містило 0,5 % дріж-
джового екстракту та 0,1 % сечовини — 1377
мг/л (табл. 2). Флавіногенна активність штаму
№ 12 (AF4/SEF1) була нижчою при викорис-
танні відходів та напівпродуктів харчової про-
мисловості (браги, сусла, меляси) та діамонію
фосфату у різних співвідношеннях. Для реком-
бінантного штаму AF4/2хSEF1, що містить дві
копії гена SEF1, максимальний вихід РФ спо-
стерігався і при вирощуванні в середовищі, що
містило 0,5 % дріжджового екстракту.
Було досліджено також вплив концентрацій
окремих компонентів середовища на синтез РФ
сконструйованими штамами з викорис тан ням ме-
тодів математичного планування ек
спериментів
(аналіз Плакета–Бермана). Додавання до середо-
вища на 50 % вищої концентрації сахарози, іонів
марганцю, кобальту та цинку приводило до зрос-
тання флавіногенезу на 25, 20, 11 та 6 % відповід-
но. Підвищені концентрації іонів калію, заліза та
міді знижують флавіногенну активність досліджу-
ваних тран с формантів на 9–17 %.
ВИСНОВКИ
За допомогою методів класичної та молеку-
лярної генетики нами було сконструйовано шта-
ми-продуценти РФ, які мають втричі вищу про-
дуктивність біосинтезу вітаміну В
2
внаслідок
введення додаткових копій гена позитивного ре-
гулятора біосинтезу РФ SEF1 у геном раніше се-
лекціонованого штаму, здатного до надсинтезу
РФ. Підібрано умови максимального виходу ці-
льового продукту — РФ при вирощуванні скон-
струйованих штамів у лабораторних умовах.
От римані штами мають найвищу продуктив-
ність флавіногенезу з усіх відомих на сьогодні
дріжджових надсинтетиків РФ.
Таблиця 1
Флавіногенна активність рекомбінантних штамів (похідних AF4), які містять додаткову копію гена SEF1,
вирощених у середовищах різного складу (5 діб вирощування)
Штам
СБ
СБ + 0,5% YE
YPD
Біомаса,
мг/мл
РФ
Біомаса,
мг/мл
РФ
Біомаса,
мг/мл
РФ
мг/л
мг/г
мг/л
мг/г
мг/л
мг/г
AF4
1,23
107,7
87,6
5,93
528,6
89,1
7,16
375,8
52,5
№ 1
1,36
281,1
207,2
5,71
1176,8
206,2
3,37
464,4
137,6
№ 8
1,17
267,0
228,8
5,27
1189,9
225,9
5,08
909,3
179,1
№ 11
0,91
279,6
305,7
4,95
930,4
187,9
5,74
698,4
121,7
№ 12
0,88
277,1
313,7
5,49
1210,4
220,6
5,20
600,2
115,3
Таблиця 2
Нагромадження РФ (мг) штамом № 12 (AF4/SEF1) C. famata у середовищах
із різними джерелами азоту
Органічне джерело
Неорганічне джерело
Немає
(NH
4
)
2
SO
4
0,3 %
(NH
4
)
2
HPO
4
0,3 %
Сечовина 0,1 %
YE, 0,5 %
958,9
1295,5
1173,1
1377,1
Пептон, 0,2 %
326,4
754,9
622,3
999,7
Сусло зернове, 1 %
7,5
262,7
242,1
652,9
Немає
—
149,4
40,6
469,2
74
Наука та інновації. № 6, 2009
Науково-технічні інноваційні проекти Національної академії наук України
Згідно з договором між Інститутом біології
клітини НАН України і ЗАТ «Ладижин» Він-
ницької обл., який передбачає масштабування
культивування продуцента, розпочато опрацю-
вання технології промислового виробництва та
очистки препарату вітаміну В
2
. Забезпечення
високих виходів біомаси при вирощуванні у
ферментерах дасть змогу налагодити економіч-
но вигідне виробництво вітаміну В
2
.
ЛІТЕРАТУРА
1. Powers H.J. Riboflavin (vitamin B-2) and health // Amer.
J. Clin. Nutr. — 2003. — Vol. 77. — P. 1352—1360.
2. Vandamme E.J., Soetaert W. 2006. Personal care products
via fermentation and biocatalysis processes. In: Biotech-
nology in Personal Care. Lad, R. (ed.). New York, USA:
Taylor and Francis. — Р. 27—56.
3. Sanchez S., Demain A. Metabolic regulation and overpro-
duction of primary metabolites // Microbial Biotechnol-
ogy. — 2008. — Vol. 1, № 4. — P. 283—319.
4. Stahmann K.P., Revuelta J.L., Seulberger H. Three bio-
technical processes using Ashbya gossypii, Candida fa-
ma ta, or Bacillus subtilis compete with chemical ribofla-
vin production // Microbiol. and Biotechnol. — 2000. —
Vol. 53, № 5 — P. 509—516.
5. Lim S.H., Choi J.S., Park E.Y. Microbial Production of Ri-
boflavin Using Riboflavin Overproducers, Ashbya gossypii,
Bacillus subtilis, and Candida famate: An Overview // Bio-
technol. Bioprocess Eng. — 2001. — Vol. 6. — P. 75—88.
6. Сибірний А.А., Федорович Д.В., Борецький Ю.Р., Воро-
новський А.Я. Мікробний синтез флавінів. Київ: Нау-
кова думка, 2006. — 253 с.
7. Survase S.A., Bajaj I.B., Singhal R.S. Biotechnological
Pro duction of Vitamins // Food Technol. Biotechnol. —
2006. — Vol. 44, № 3. — P. 381—396.
8. Karos M., Vilarino C., Bollschweiler C., Revuelta J.L. A ge-
nome-wide transcription analysis of a fungal riboflavin
overproducer // J. Biotechnol. — 2004. — Vol. 113. — P. 69—
76.
9. Dmytruk K.V., Voronovsky A.Y., Sibirny A.A. Insertion mu-
tagenesis of the yeast Candida famata (Debaryomy ces ha-
nsenii) by random integration of linear DNA frag ments //
Curr. Genet. — 2006. — Vol. 50, № 3. — P. 183–191.
10. Voronovsky A, Abbas C.A., Fayura L.R. et al. Development
of a transformation system for the flavinogenic yeast.
Candida famata // FEMS Yeast Res. — 2002. Vol. 2,
№ 3. — P. 381–388.
11. Sambrook J., Fritsh E.F., Maniatis T. Molecular Cloning: A
La boratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold
Spring Harbor, New York. 1989.
12. Патент України на корисну модель № 36164 від
10.10.2008 р., бюл. № 19.
13. Hyle J.W., Shaw R.J., Reines D. Functional distinctions
bet ween IMP dehydrogenase genes in providing my co-
phenolate resistance and guanine prototrophy to yeast //
J. Biol. Chem. — 2003. — Vol. 278, № 31. — P. 28470—
28478.
К.В. Дмитрук, В.Ю. Яцишин,
А.Я. Вороновский, Д.В. Федорович, А.А. Сибирный
КОНСТРУИРОВАНИЕ СВЕРХПРОДУЦЕНТОВ
РИБОФЛАВИНА (ВИТАМИНА В
2
)
ДРОЖЖЕЙ CANDIDA FAMATA
Путем введения дополнительных копий гена позитив-
ного регулятора биосинтеза рибофлавина (РФ) в геном
селекционированных ранее штаммов дрожжей Can dida
famata, способных к сверхсинтезу РФ, получены ста-
бильные дрожжевые штаммы-сверхпродуценты витами-
на В
2
. Подобраны оптимальные среды и условия ку ль-
тивирования для максимального выхода целевого про-
дукта — РФ.
К л ю ч е в ы е с л о в а: рибофлавин (витамин В
2
), дрож-
жи, Candida famata, сверхсинтез, штаммы-продуценты.
K.V. Dmytruk, V.Y. Yatsyshyn,
A.Y. Voronovsky, D.V. Fedorovych, A.A. Sibirny
CONSTRUCTION OF RIBOFLAVIN (VITAMIN B
2
)
OVERPRODUCERS OF THE YEAST
CANDIDA FAMATA
The stable riboflavin (RF) overproducers were isolated
by means of amplification of the gene encoding positive reg-
ulator of RF synthesis into selected earlier C. famata flavi-
nogenic strains. The medium components and cultivation
conditions were optimized for maximal accumulation of
product (RF).
K e y w o r d s: riboflavin (vitamin B
2
), yeast, Candida fa-
ma ta, oversynthesis, overproducers.
Надійшла до редакції 17.04.09.
Достарыңызбен бөлісу: |