Белки – пространственное строение и функции Белки в организме



Дата18.08.2018
өлшемі520 b.


Белки – пространственное строение и функции


Белки в организме

  • Белки составляют ~15% массы тела среднего человека.

  • Функции белков: структурные белки, каталитические белки, транспорт и депо, регуляторные и рецепторные белки и белки иммунной системы (защитные), моторная и сократительная функции

  • Большинство тканей тела состоит из белков.

  • Многие болезни имеют причиной модификацию тех или иных белков.



Какой процент человеческого протеома имеет известную структуру ?

  • Крупные фармацевтические компании выявили множество структур, но большинство из них не депонировано в Protein Data Bank.

  • ~40,000 генов в человеческом геноме.

  • ~25,000 записей в Protein Data Bank:

    • a. ~5,600 точных записей хорошего качества.
    • b. ~1,100 из них – человеческие белки
    • c. И эти записи в основном – единичные домены или фрагменты белков.
  • Ответ (эмпирический): ~1%

  • Ответ (моделирование гомологов): ~20% доменов



Разнообразие белков



Уровни структур белков

  • Первичная структура – последовательность аминокислот

  • Вторичная структура – локальная организация полипептидной цепи без учёта возможных конформаций боковых цепей (R групп).

  • Третичная структура – 3D структура всего протеина, включая конформации боковых цепей.

  • Четвертичная структура – 3D структура организации субъединиц белка.



Аминокислоты



Аминокислоты



Аминокислоты – боковые цепи



Пептидные связи



Пептидные связи



Аминокислоты Боковые цепи



Аминокислоты Боковые цепи



Основные белковые структуры

  • Первичная структура – последовательность аминокислот

  • Вторичная структура – это локальная организация главной полипептидной цепи без учёта конформаций отдельных боковых групп (R групп).



Вторичная структура.  спираль ( helix)

      • H связь: N-H i -> C=O i+4
      • Linus Pauling, Robert Corey, Max Perutz


Правозакрученная спираль.

  • Правозакрученная спираль.

  • Каждая аминокислота соответствует повороту на 100° - 3,6 аминокислоты на виток и трансляции на 1,5 Å вдоль оси.





 спираль - представление



Вторичные структуры. структуры



Вторичные структуры.  структуры Геометрия



структуры - представление



Обратные повороты и петли



Super Secondary элементы: мотивы



Ramachandran Plot



Ramachandran Plot



Домены



Основные структуры белков

  • Третичная структура – 3D структура всего белка с учётом конформации боковых цепей.

  • Четвертичная структура – 3D организация субъединиц (доменов) и белков в надмолекулярные комплексы





-/ 3D белковые структуры



α+β 3D белковые структуры







Достарыңызбен бөлісу:


©stom.tilimen.org 2019
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет